Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
H2-M1F7CXU4 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
H2-M1F7CXU4 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
H2-M1F7CXU4 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
H2-M1F7CXU4 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
H2-M1F7CXU4 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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H2-M1F7CXU4 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
H2-M1F7CXU4 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
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H2-M1F7CXU4 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
H2-M1F7CXU4 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
H2-M1F7CXU4 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
H2-M1F7CXU4 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
H2-M1F7CXU4 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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H2-M1F7CXU4 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
H2-M1F7CXU4 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
H2-M1F7CXU4 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
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H2-M1F7CXU4 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
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H2-M1F7CXU4 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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H2-M1F7CXU4 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
H2-M1F7CXU4 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
H2-M1F7CXU4 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
H2-M1F7CXU4 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
H2-M1F7CXU4 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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H2-M1F7CXU4 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
H2-M1F7CXU4 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
H2-M1F7CXU4 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2-M1F7CXU4 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2-M1F7CXU4 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2-M1F7CXU4 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2-M1F7CXU4 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
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H2-M1F7CXU4 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
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H2-M1F7CXU4 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2-M1F7CXU4 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
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H2-M1F7CXU4 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
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H2-M1F7CXU4 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2-M1F7CXU4 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
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H2-M1F7CXU4 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
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H2-M1F7CXU4 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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