Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Gm28048F7BCN0 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Gm28048F7BCN0 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Gm28048F7BCN0 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Gm28048F7BCN0 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Gm28048F7BCN0 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Gm28048F7BCN0 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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