Protein–RNA interactions for Protein: E9Q548

Gm20518, Predicted gene 20518, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20518E9Q548 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20518E9Q548 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20518E9Q548 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20518E9Q548 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20518E9Q548 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20518E9Q548 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20518E9Q548 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Gm20518E9Q548 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20518E9Q548 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20518E9Q548 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20518E9Q548 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20518E9Q548 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Gm20518E9Q548 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Gm20518E9Q548 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20518E9Q548 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20518E9Q548 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20518E9Q548 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20518E9Q548 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20518E9Q548 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20518E9Q548 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20518E9Q548 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20518E9Q548 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20518E9Q548 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20518E9Q548 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Gm20518E9Q548 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20518E9Q548 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20518E9Q548 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20518E9Q548 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20518E9Q548 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20518E9Q548 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20518E9Q548 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20518E9Q548 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20518E9Q548 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20518E9Q548 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20518E9Q548 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20518E9Q548 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20518E9Q548 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20518E9Q548 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20518E9Q548 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20518E9Q548 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Gm20518E9Q548 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20518E9Q548 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20518E9Q548 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Gm20518E9Q548 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20518E9Q548 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20518E9Q548 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Gm20518E9Q548 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20518E9Q548 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20518E9Q548 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20518E9Q548 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20518E9Q548 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20518E9Q548 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20518E9Q548 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Gm20518E9Q548 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20518E9Q548 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20518E9Q548 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20518E9Q548 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20518E9Q548 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20518E9Q548 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20518E9Q548 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20518E9Q548 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20518E9Q548 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20518E9Q548 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20518E9Q548 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20518E9Q548 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20518E9Q548 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20518E9Q548 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20518E9Q548 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20518E9Q548 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20518E9Q548 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20518E9Q548 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20518E9Q548 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20518E9Q548 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20518E9Q548 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20518E9Q548 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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