Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms