Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Gm42047-202ENSMUST00000212899 4988 ntTSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Cspg4-201ENSMUST00000035661 8121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Col4a4-201ENSMUST00000087050 10108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC7.71□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Spata13-201ENSMUST00000022566 7517 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Lrat-201ENSMUST00000029632 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Utrn-206ENSMUST00000219003 5751 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Cacna1c-202ENSMUST00000078320 8062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Setd1b-201ENSMUST00000056053 7362 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Faim2-201ENSMUST00000023750 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Pak7-201ENSMUST00000035264 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms