Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE7

Otud4, OTU domain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud4B2RRE7 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Otud4B2RRE7 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Otud4B2RRE7 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Otud4B2RRE7 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Otud4B2RRE7 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Otud4B2RRE7 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Otud4B2RRE7 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Otud4B2RRE7 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Otud4B2RRE7 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Otud4B2RRE7 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Otud4B2RRE7 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Otud4B2RRE7 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Otud4B2RRE7 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Otud4B2RRE7 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Otud4B2RRE7 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Otud4B2RRE7 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Otud4B2RRE7 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Otud4B2RRE7 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Otud4B2RRE7 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Otud4B2RRE7 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Otud4B2RRE7 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Otud4B2RRE7 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Otud4B2RRE7 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Otud4B2RRE7 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Otud4B2RRE7 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Otud4B2RRE7 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Otud4B2RRE7 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Otud4B2RRE7 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Otud4B2RRE7 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Otud4B2RRE7 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Otud4B2RRE7 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Otud4B2RRE7 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Otud4B2RRE7 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Otud4B2RRE7 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Otud4B2RRE7 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Otud4B2RRE7 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Otud4B2RRE7 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Otud4B2RRE7 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Otud4B2RRE7 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Otud4B2RRE7 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Otud4B2RRE7 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Otud4B2RRE7 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Otud4B2RRE7 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Otud4B2RRE7 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Otud4B2RRE7 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Otud4B2RRE7 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Otud4B2RRE7 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Otud4B2RRE7 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Otud4B2RRE7 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Otud4B2RRE7 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Otud4B2RRE7 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Otud4B2RRE7 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Otud4B2RRE7 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Otud4B2RRE7 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Otud4B2RRE7 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Otud4B2RRE7 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Otud4B2RRE7 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Otud4B2RRE7 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Otud4B2RRE7 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Otud4B2RRE7 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Otud4B2RRE7 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Otud4B2RRE7 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Otud4B2RRE7 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Otud4B2RRE7 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Otud4B2RRE7 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Otud4B2RRE7 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Otud4B2RRE7 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Otud4B2RRE7 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Otud4B2RRE7 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Otud4B2RRE7 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Otud4B2RRE7 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Otud4B2RRE7 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Otud4B2RRE7 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Otud4B2RRE7 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Otud4B2RRE7 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Otud4B2RRE7 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Otud4B2RRE7 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Otud4B2RRE7 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Otud4B2RRE7 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Otud4B2RRE7 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Otud4B2RRE7 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Otud4B2RRE7 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Otud4B2RRE7 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Otud4B2RRE7 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Otud4B2RRE7 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Otud4B2RRE7 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Otud4B2RRE7 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Otud4B2RRE7 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Otud4B2RRE7 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Otud4B2RRE7 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Otud4B2RRE7 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Otud4B2RRE7 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Otud4B2RRE7 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Otud4B2RRE7 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Otud4B2RRE7 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Otud4B2RRE7 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Otud4B2RRE7 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Otud4B2RRE7 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Otud4B2RRE7 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Otud4B2RRE7 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms