Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 CT010431.1-201ENSMUST00000221249 1080 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms