Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms