Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

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Length 936 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Spocd1B1ASB6 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms