Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm6880A3KG45 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm6880A3KG45 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm6880A3KG45 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm6880A3KG45 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm6880A3KG45 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm6880A3KG45 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm6880A3KG45 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm6880A3KG45 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm6880A3KG45 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm6880A3KG45 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm6880A3KG45 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm6880A3KG45 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm6880A3KG45 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm6880A3KG45 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm6880A3KG45 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm6880A3KG45 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm6880A3KG45 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm6880A3KG45 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm6880A3KG45 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm6880A3KG45 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm6880A3KG45 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm6880A3KG45 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm6880A3KG45 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm6880A3KG45 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm6880A3KG45 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm6880A3KG45 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm6880A3KG45 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm6880A3KG45 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm6880A3KG45 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm6880A3KG45 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm6880A3KG45 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm6880A3KG45 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm6880A3KG45 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm6880A3KG45 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm6880A3KG45 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm6880A3KG45 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm6880A3KG45 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm6880A3KG45 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm6880A3KG45 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm6880A3KG45 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm6880A3KG45 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm6880A3KG45 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm6880A3KG45 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm6880A3KG45 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm6880A3KG45 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm6880A3KG45 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm6880A3KG45 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm6880A3KG45 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm6880A3KG45 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm6880A3KG45 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm6880A3KG45 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm6880A3KG45 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm6880A3KG45 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm6880A3KG45 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm6880A3KG45 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm6880A3KG45 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm6880A3KG45 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm6880A3KG45 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm6880A3KG45 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm6880A3KG45 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm6880A3KG45 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm6880A3KG45 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm6880A3KG45 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm6880A3KG45 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm6880A3KG45 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm6880A3KG45 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm6880A3KG45 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm6880A3KG45 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm6880A3KG45 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm6880A3KG45 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm6880A3KG45 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm6880A3KG45 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm6880A3KG45 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm6880A3KG45 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm6880A3KG45 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm6880A3KG45 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm6880A3KG45 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm6880A3KG45 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm6880A3KG45 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm6880A3KG45 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm6880A3KG45 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm6880A3KG45 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm6880A3KG45 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm6880A3KG45 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm6880A3KG45 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm6880A3KG45 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm6880A3KG45 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm6880A3KG45 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm6880A3KG45 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm6880A3KG45 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm6880A3KG45 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm6880A3KG45 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm6880A3KG45 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm6880A3KG45 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm6880A3KG45 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm6880A3KG45 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm6880A3KG45 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm6880A3KG45 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm6880A3KG45 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms