Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

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Length 1,947 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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