Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
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