Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V9

Ccni, Cyclin-I, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcniQ9Z2V9 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
CcniQ9Z2V9 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
CcniQ9Z2V9 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
CcniQ9Z2V9 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
CcniQ9Z2V9 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
CcniQ9Z2V9 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
CcniQ9Z2V9 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
CcniQ9Z2V9 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
CcniQ9Z2V9 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
CcniQ9Z2V9 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
CcniQ9Z2V9 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
CcniQ9Z2V9 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
CcniQ9Z2V9 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
CcniQ9Z2V9 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.62
CcniQ9Z2V9 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
CcniQ9Z2V9 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms