Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

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Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms