Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTJ8

Fam50b, Protein FAM50B, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam50bQ9WTJ8 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Fam50bQ9WTJ8 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Fam50bQ9WTJ8 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Fam50bQ9WTJ8 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Fam50bQ9WTJ8 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Fam50bQ9WTJ8 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Fam50bQ9WTJ8 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Fam50bQ9WTJ8 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Fam50bQ9WTJ8 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Fam50bQ9WTJ8 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fam50bQ9WTJ8 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Fam50bQ9WTJ8 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fam50bQ9WTJ8 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fam50bQ9WTJ8 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms