Protein–RNA interactions for Protein: Q9R233

Tapbp, Tapasin, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TapbpQ9R233 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
TapbpQ9R233 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
TapbpQ9R233 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
TapbpQ9R233 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
TapbpQ9R233 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
TapbpQ9R233 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
TapbpQ9R233 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
TapbpQ9R233 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
TapbpQ9R233 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TapbpQ9R233 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TapbpQ9R233 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TapbpQ9R233 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TapbpQ9R233 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TapbpQ9R233 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TapbpQ9R233 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TapbpQ9R233 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TapbpQ9R233 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TapbpQ9R233 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TapbpQ9R233 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TapbpQ9R233 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TapbpQ9R233 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
TapbpQ9R233 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TapbpQ9R233 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
TapbpQ9R233 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TapbpQ9R233 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TapbpQ9R233 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TapbpQ9R233 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TapbpQ9R233 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
TapbpQ9R233 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TapbpQ9R233 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TapbpQ9R233 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TapbpQ9R233 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TapbpQ9R233 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TapbpQ9R233 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TapbpQ9R233 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
TapbpQ9R233 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
TapbpQ9R233 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
TapbpQ9R233 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TapbpQ9R233 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
TapbpQ9R233 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TapbpQ9R233 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TapbpQ9R233 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TapbpQ9R233 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TapbpQ9R233 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
TapbpQ9R233 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TapbpQ9R233 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
TapbpQ9R233 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TapbpQ9R233 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TapbpQ9R233 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TapbpQ9R233 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TapbpQ9R233 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TapbpQ9R233 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
TapbpQ9R233 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TapbpQ9R233 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TapbpQ9R233 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TapbpQ9R233 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TapbpQ9R233 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TapbpQ9R233 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TapbpQ9R233 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TapbpQ9R233 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TapbpQ9R233 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TapbpQ9R233 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TapbpQ9R233 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TapbpQ9R233 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TapbpQ9R233 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TapbpQ9R233 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TapbpQ9R233 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TapbpQ9R233 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TapbpQ9R233 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TapbpQ9R233 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TapbpQ9R233 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TapbpQ9R233 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TapbpQ9R233 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TapbpQ9R233 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TapbpQ9R233 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TapbpQ9R233 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
TapbpQ9R233 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TapbpQ9R233 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
TapbpQ9R233 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
TapbpQ9R233 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TapbpQ9R233 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TapbpQ9R233 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TapbpQ9R233 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
TapbpQ9R233 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
TapbpQ9R233 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
TapbpQ9R233 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TapbpQ9R233 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TapbpQ9R233 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
TapbpQ9R233 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
TapbpQ9R233 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TapbpQ9R233 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TapbpQ9R233 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TapbpQ9R233 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TapbpQ9R233 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TapbpQ9R233 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TapbpQ9R233 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TapbpQ9R233 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TapbpQ9R233 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TapbpQ9R233 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TapbpQ9R233 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms