Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
AmfrQ9R049 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms