Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnf4Q9QZS2 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnf4Q9QZS2 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnf4Q9QZS2 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnf4Q9QZS2 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnf4Q9QZS2 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnf4Q9QZS2 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnf4Q9QZS2 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnf4Q9QZS2 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnf4Q9QZS2 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnf4Q9QZS2 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnf4Q9QZS2 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnf4Q9QZS2 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnf4Q9QZS2 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnf4Q9QZS2 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnf4Q9QZS2 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnf4Q9QZS2 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnf4Q9QZS2 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnf4Q9QZS2 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Rnf4Q9QZS2 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Rnf4Q9QZS2 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Rnf4Q9QZS2 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Rnf4Q9QZS2 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Rnf4Q9QZS2 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rnf4Q9QZS2 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rnf4Q9QZS2 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rnf4Q9QZS2 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rnf4Q9QZS2 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rnf4Q9QZS2 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rnf4Q9QZS2 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rnf4Q9QZS2 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rnf4Q9QZS2 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rnf4Q9QZS2 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rnf4Q9QZS2 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Rnf4Q9QZS2 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rnf4Q9QZS2 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rnf4Q9QZS2 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rnf4Q9QZS2 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rnf4Q9QZS2 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Rnf4Q9QZS2 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Rnf4Q9QZS2 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rnf4Q9QZS2 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rnf4Q9QZS2 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rnf4Q9QZS2 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rnf4Q9QZS2 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rnf4Q9QZS2 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rnf4Q9QZS2 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rnf4Q9QZS2 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rnf4Q9QZS2 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rnf4Q9QZS2 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rnf4Q9QZS2 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rnf4Q9QZS2 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rnf4Q9QZS2 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rnf4Q9QZS2 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rnf4Q9QZS2 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Rnf4Q9QZS2 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rnf4Q9QZS2 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rnf4Q9QZS2 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rnf4Q9QZS2 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rnf4Q9QZS2 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rnf4Q9QZS2 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rnf4Q9QZS2 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Rnf4Q9QZS2 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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Rnf4Q9QZS2 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rnf4Q9QZS2 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rnf4Q9QZS2 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rnf4Q9QZS2 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rnf4Q9QZS2 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rnf4Q9QZS2 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rnf4Q9QZS2 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rnf4Q9QZS2 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rnf4Q9QZS2 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rnf4Q9QZS2 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rnf4Q9QZS2 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rnf4Q9QZS2 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rnf4Q9QZS2 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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Rnf4Q9QZS2 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rnf4Q9QZS2 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rnf4Q9QZS2 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Rnf4Q9QZS2 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rnf4Q9QZS2 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Rnf4Q9QZS2 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rnf4Q9QZS2 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rnf4Q9QZS2 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rnf4Q9QZS2 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rnf4Q9QZS2 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rnf4Q9QZS2 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Rnf4Q9QZS2 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rnf4Q9QZS2 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rnf4Q9QZS2 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rnf4Q9QZS2 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rnf4Q9QZS2 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rnf4Q9QZS2 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rnf4Q9QZS2 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
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