Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
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Col4a3Q9QZS0 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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