Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tnnt3Q9QZ47 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tnnt3Q9QZ47 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tnnt3Q9QZ47 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tnnt3Q9QZ47 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tnnt3Q9QZ47 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tnnt3Q9QZ47 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnnt3Q9QZ47 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnnt3Q9QZ47 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnnt3Q9QZ47 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnnt3Q9QZ47 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnnt3Q9QZ47 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnnt3Q9QZ47 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnnt3Q9QZ47 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnnt3Q9QZ47 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnnt3Q9QZ47 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnnt3Q9QZ47 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnnt3Q9QZ47 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnnt3Q9QZ47 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms