Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ09

Phtf1, Putative homeodomain transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 761 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf1Q9QZ09 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Phtf1Q9QZ09 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Phtf1Q9QZ09 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Phtf1Q9QZ09 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Phtf1Q9QZ09 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Phtf1Q9QZ09 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Phtf1Q9QZ09 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Phtf1Q9QZ09 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Phtf1Q9QZ09 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Phtf1Q9QZ09 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Phtf1Q9QZ09 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Phtf1Q9QZ09 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Phtf1Q9QZ09 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Phtf1Q9QZ09 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Phtf1Q9QZ09 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Phtf1Q9QZ09 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Phtf1Q9QZ09 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Phtf1Q9QZ09 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Phtf1Q9QZ09 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Phtf1Q9QZ09 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Phtf1Q9QZ09 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Phtf1Q9QZ09 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Phtf1Q9QZ09 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Phtf1Q9QZ09 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Phtf1Q9QZ09 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Phtf1Q9QZ09 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Phtf1Q9QZ09 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Phtf1Q9QZ09 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Phtf1Q9QZ09 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Phtf1Q9QZ09 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Phtf1Q9QZ09 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Phtf1Q9QZ09 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Phtf1Q9QZ09 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Phtf1Q9QZ09 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Phtf1Q9QZ09 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Phtf1Q9QZ09 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Phtf1Q9QZ09 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Phtf1Q9QZ09 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Phtf1Q9QZ09 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Phtf1Q9QZ09 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Phtf1Q9QZ09 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Phtf1Q9QZ09 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Phtf1Q9QZ09 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Phtf1Q9QZ09 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Phtf1Q9QZ09 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Phtf1Q9QZ09 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Phtf1Q9QZ09 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Phtf1Q9QZ09 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Phtf1Q9QZ09 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Phtf1Q9QZ09 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Phtf1Q9QZ09 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Phtf1Q9QZ09 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Phtf1Q9QZ09 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Phtf1Q9QZ09 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Phtf1Q9QZ09 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Phtf1Q9QZ09 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Phtf1Q9QZ09 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Phtf1Q9QZ09 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Phtf1Q9QZ09 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Phtf1Q9QZ09 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Phtf1Q9QZ09 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phtf1Q9QZ09 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Phtf1Q9QZ09 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phtf1Q9QZ09 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phtf1Q9QZ09 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phtf1Q9QZ09 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phtf1Q9QZ09 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phtf1Q9QZ09 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phtf1Q9QZ09 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phtf1Q9QZ09 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phtf1Q9QZ09 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phtf1Q9QZ09 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Phtf1Q9QZ09 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phtf1Q9QZ09 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phtf1Q9QZ09 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phtf1Q9QZ09 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phtf1Q9QZ09 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Phtf1Q9QZ09 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Phtf1Q9QZ09 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Phtf1Q9QZ09 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Phtf1Q9QZ09 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phtf1Q9QZ09 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Phtf1Q9QZ09 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Phtf1Q9QZ09 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phtf1Q9QZ09 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Phtf1Q9QZ09 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Phtf1Q9QZ09 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phtf1Q9QZ09 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phtf1Q9QZ09 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phtf1Q9QZ09 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phtf1Q9QZ09 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phtf1Q9QZ09 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phtf1Q9QZ09 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phtf1Q9QZ09 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phtf1Q9QZ09 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phtf1Q9QZ09 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Phtf1Q9QZ09 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phtf1Q9QZ09 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phtf1Q9QZ09 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phtf1Q9QZ09 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.3 ms