Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLM8

Dclk1, Serine/threonine-protein kinase DCLK1, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclk1Q9JLM8 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Slc31a2-202ENSMUST00000107467 868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Itpa-ps1-201ENSMUST00000117207 597 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Gm13171-201ENSMUST00000117233 391 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Rrm2b-207ENSMUST00000146821 420 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Gm13267-202ENSMUST00000150099 281 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Prr33-202ENSMUST00000151580 399 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 1110020A21Rik-201ENSMUST00000181147 853 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Tmem242-202ENSMUST00000185896 780 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Gm37851-201ENSMUST00000193871 889 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Mrpl23-207ENSMUST00000210803 590 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 AC153887.1-201ENSMUST00000219154 1253 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Tnfrsf18-201ENSMUST00000040274 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Gm9791-201ENSMUST00000060997 447 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Gm10580-201ENSMUST00000097985 396 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Gm10581-201ENSMUST00000097986 231 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Gm10582-201ENSMUST00000097987 396 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Gm10583-201ENSMUST00000097988 396 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Oma1-201ENSMUST00000035780 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Gm13192-201ENSMUST00000101199 208 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Gm10443-201ENSMUST00000119024 210 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Gm18552-201ENSMUST00000187425 538 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Gm20568-201ENSMUST00000197129 208 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Gm42430-201ENSMUST00000197209 616 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Nme6-214ENSMUST00000200468 865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Gm5650-201ENSMUST00000209641 598 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Gm7082-201ENSMUST00000209880 969 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Tmod3-205ENSMUST00000215821 898 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Akr1c18-201ENSMUST00000021635 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 AC129975.1-201ENSMUST00000224816 592 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms