Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC10.58□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms