Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ybx3Q9JKB3 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ybx3Q9JKB3 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ybx3Q9JKB3 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ybx3Q9JKB3 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ybx3Q9JKB3 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ybx3Q9JKB3 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ybx3Q9JKB3 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ybx3Q9JKB3 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ybx3Q9JKB3 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ybx3Q9JKB3 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ybx3Q9JKB3 Gm24279-201ENSMUST00000104236 131 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ybx3Q9JKB3 Tprkb-204ENSMUST00000113752 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ybx3Q9JKB3 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ybx3Q9JKB3 Mir1905-201ENSMUST00000122779 82 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ybx3Q9JKB3 Polr3c-205ENSMUST00000141377 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ybx3Q9JKB3 Gm15506-201ENSMUST00000148776 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ybx3Q9JKB3 Gm16030-201ENSMUST00000159098 603 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ybx3Q9JKB3 Gm20471-201ENSMUST00000172793 626 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ybx3Q9JKB3 Gm43547-201ENSMUST00000197729 328 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ybx3Q9JKB3 Ighv1-86-201ENSMUST00000200562 353 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ybx3Q9JKB3 Gm44216-201ENSMUST00000203942 157 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ybx3Q9JKB3 BC049987-201ENSMUST00000213859 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ybx3Q9JKB3 Rhox8-201ENSMUST00000071885 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ybx3Q9JKB3 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ybx3Q9JKB3 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ybx3Q9JKB3 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ybx3Q9JKB3 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ybx3Q9JKB3 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ybx3Q9JKB3 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ybx3Q9JKB3 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ybx3Q9JKB3 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ybx3Q9JKB3 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ybx3Q9JKB3 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ybx3Q9JKB3 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ybx3Q9JKB3 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ybx3Q9JKB3 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ybx3Q9JKB3 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ybx3Q9JKB3 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ybx3Q9JKB3 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ybx3Q9JKB3 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ybx3Q9JKB3 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ybx3Q9JKB3 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ybx3Q9JKB3 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ybx3Q9JKB3 Gm9625-201ENSMUST00000180422 955 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ybx3Q9JKB3 Gm9162-201ENSMUST00000182081 991 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ybx3Q9JKB3 Gm8756-201ENSMUST00000183250 929 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ybx3Q9JKB3 1700001J11Rik-201ENSMUST00000185917 759 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ybx3Q9JKB3 Nme6-214ENSMUST00000200468 865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ybx3Q9JKB3 Gm30731-201ENSMUST00000203909 825 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ybx3Q9JKB3 Gm5907-202ENSMUST00000210969 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ybx3Q9JKB3 Olfr335-ps-201ENSMUST00000223545 939 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ybx3Q9JKB3 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ybx3Q9JKB3 P2rx7-202ENSMUST00000086247 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ybx3Q9JKB3 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Unc119-202ENSMUST00000100755 933 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Tnfrsf14-201ENSMUST00000123514 1018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 1700017I07Rik-201ENSMUST00000184823 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 1810013D15Rik-201ENSMUST00000029827 300 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Gm9791-201ENSMUST00000060997 447 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Gm2721-201ENSMUST00000222380 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 4921524J17Rik-201ENSMUST00000047749 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms