Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Gm3433-201ENSMUST00000210149 1058 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Rb1cc1Q9ESK9 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rb1cc1Q9ESK9 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rb1cc1Q9ESK9 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rb1cc1Q9ESK9 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rb1cc1Q9ESK9 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rb1cc1Q9ESK9 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rb1cc1Q9ESK9 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rb1cc1Q9ESK9 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rb1cc1Q9ESK9 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rb1cc1Q9ESK9 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rb1cc1Q9ESK9 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rb1cc1Q9ESK9 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rb1cc1Q9ESK9 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Rb1cc1Q9ESK9 Gm9673-201ENSMUST00000119287 781 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Rb1cc1Q9ESK9 Fxyd5-209ENSMUST00000162087 762 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rb1cc1Q9ESK9 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rb1cc1Q9ESK9 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Rb1cc1Q9ESK9 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rb1cc1Q9ESK9 AC153962.2-201ENSMUST00000219417 550 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Rb1cc1Q9ESK9 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rb1cc1Q9ESK9 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rb1cc1Q9ESK9 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rb1cc1Q9ESK9 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rb1cc1Q9ESK9 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rb1cc1Q9ESK9 E330011O21Rik-202ENSMUST00000209498 1403 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rb1cc1Q9ESK9 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rb1cc1Q9ESK9 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rb1cc1Q9ESK9 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rb1cc1Q9ESK9 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rb1cc1Q9ESK9 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rb1cc1Q9ESK9 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rb1cc1Q9ESK9 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Rb1cc1Q9ESK9 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rb1cc1Q9ESK9 Isoc2b-205ENSMUST00000208816 820 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rb1cc1Q9ESK9 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rb1cc1Q9ESK9 Retnla-201ENSMUST00000023329 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rb1cc1Q9ESK9 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rb1cc1Q9ESK9 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rb1cc1Q9ESK9 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rb1cc1Q9ESK9 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rb1cc1Q9ESK9 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rb1cc1Q9ESK9 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rb1cc1Q9ESK9 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rb1cc1Q9ESK9 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rb1cc1Q9ESK9 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rb1cc1Q9ESK9 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rb1cc1Q9ESK9 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rb1cc1Q9ESK9 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rb1cc1Q9ESK9 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rb1cc1Q9ESK9 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Rb1cc1Q9ESK9 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rb1cc1Q9ESK9 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rb1cc1Q9ESK9 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rb1cc1Q9ESK9 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rb1cc1Q9ESK9 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rb1cc1Q9ESK9 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rb1cc1Q9ESK9 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rb1cc1Q9ESK9 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rb1cc1Q9ESK9 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rb1cc1Q9ESK9 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rb1cc1Q9ESK9 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rb1cc1Q9ESK9 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Rb1cc1Q9ESK9 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Rb1cc1Q9ESK9 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rb1cc1Q9ESK9 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Rb1cc1Q9ESK9 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rb1cc1Q9ESK9 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rb1cc1Q9ESK9 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rb1cc1Q9ESK9 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rb1cc1Q9ESK9 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rb1cc1Q9ESK9 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rb1cc1Q9ESK9 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rb1cc1Q9ESK9 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rb1cc1Q9ESK9 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rb1cc1Q9ESK9 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rb1cc1Q9ESK9 Opn1mw-202ENSMUST00000101457 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rb1cc1Q9ESK9 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rb1cc1Q9ESK9 Tcf7l2-204ENSMUST00000111649 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rb1cc1Q9ESK9 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Rb1cc1Q9ESK9 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Rb1cc1Q9ESK9 Gm4924-205ENSMUST00000211099 490 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rb1cc1Q9ESK9 Tcf25-210ENSMUST00000212880 827 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rb1cc1Q9ESK9 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rb1cc1Q9ESK9 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rb1cc1Q9ESK9 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rb1cc1Q9ESK9 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rb1cc1Q9ESK9 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rb1cc1Q9ESK9 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rb1cc1Q9ESK9 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rb1cc1Q9ESK9 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Rb1cc1Q9ESK9 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rb1cc1Q9ESK9 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms