Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES61

Ms4a4b, Chandra protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4bQ9ES61 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Scp2-ps2-203ENSMUST00000216438 1370 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Zwilch-209ENSMUST00000176299 1831 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Gm15379-201ENSMUST00000121224 648 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Krr1-204ENSMUST00000174653 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Gm29354-201ENSMUST00000187613 696 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Gm19066-201ENSMUST00000193232 1078 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Gm43192-201ENSMUST00000198002 637 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 0610033M10Rik-202ENSMUST00000205236 1102 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Glipr1l3-201ENSMUST00000220085 892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Vmn1r73-201ENSMUST00000055070 912 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Olfr791-201ENSMUST00000057477 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Prpf18-204ENSMUST00000152362 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Olfr702-201ENSMUST00000080899 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Gm21897-201ENSMUST00000178312 1500 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Mup-ps14-201ENSMUST00000118437 532 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Gm14103-201ENSMUST00000119075 366 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Gm11255-201ENSMUST00000120448 1180 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Vmn1r-ps53-201ENSMUST00000173066 922 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Gm21294-201ENSMUST00000186443 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Gm43674-201ENSMUST00000196313 791 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Gm44392-201ENSMUST00000196758 115 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Gm21049-201ENSMUST00000197078 987 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Gm45391-201ENSMUST00000211563 576 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Gm18645-202ENSMUST00000212222 760 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 AC157017.2-201ENSMUST00000218354 777 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Vmn1r36-202ENSMUST00000226635 918 ntAPPRIS P2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms