Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf6Q9DBU5 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf6Q9DBU5 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf6Q9DBU5 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf6Q9DBU5 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf6Q9DBU5 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf6Q9DBU5 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf6Q9DBU5 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf6Q9DBU5 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf6Q9DBU5 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf6Q9DBU5 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf6Q9DBU5 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf6Q9DBU5 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf6Q9DBU5 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf6Q9DBU5 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf6Q9DBU5 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf6Q9DBU5 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf6Q9DBU5 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf6Q9DBU5 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf6Q9DBU5 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf6Q9DBU5 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf6Q9DBU5 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf6Q9DBU5 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf6Q9DBU5 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf6Q9DBU5 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf6Q9DBU5 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf6Q9DBU5 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf6Q9DBU5 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf6Q9DBU5 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf6Q9DBU5 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf6Q9DBU5 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf6Q9DBU5 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf6Q9DBU5 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf6Q9DBU5 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf6Q9DBU5 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf6Q9DBU5 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf6Q9DBU5 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf6Q9DBU5 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf6Q9DBU5 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf6Q9DBU5 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf6Q9DBU5 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf6Q9DBU5 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf6Q9DBU5 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf6Q9DBU5 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf6Q9DBU5 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf6Q9DBU5 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf6Q9DBU5 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf6Q9DBU5 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf6Q9DBU5 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf6Q9DBU5 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf6Q9DBU5 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf6Q9DBU5 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf6Q9DBU5 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf6Q9DBU5 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf6Q9DBU5 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf6Q9DBU5 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf6Q9DBU5 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf6Q9DBU5 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf6Q9DBU5 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf6Q9DBU5 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf6Q9DBU5 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf6Q9DBU5 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf6Q9DBU5 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf6Q9DBU5 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf6Q9DBU5 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf6Q9DBU5 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf6Q9DBU5 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf6Q9DBU5 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf6Q9DBU5 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf6Q9DBU5 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf6Q9DBU5 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf6Q9DBU5 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf6Q9DBU5 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf6Q9DBU5 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf6Q9DBU5 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf6Q9DBU5 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf6Q9DBU5 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf6Q9DBU5 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf6Q9DBU5 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf6Q9DBU5 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf6Q9DBU5 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf6Q9DBU5 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf6Q9DBU5 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf6Q9DBU5 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf6Q9DBU5 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf6Q9DBU5 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf6Q9DBU5 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf6Q9DBU5 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf6Q9DBU5 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf6Q9DBU5 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf6Q9DBU5 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf6Q9DBU5 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf6Q9DBU5 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf6Q9DBU5 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf6Q9DBU5 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf6Q9DBU5 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf6Q9DBU5 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf6Q9DBU5 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf6Q9DBU5 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf6Q9DBU5 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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