Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.1 ms