Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F1

Alkbh4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh4Q9D8F1 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Alkbh4Q9D8F1 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Alkbh4Q9D8F1 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Alkbh4Q9D8F1 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Alkbh4Q9D8F1 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Alkbh4Q9D8F1 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Alkbh4Q9D8F1 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86 ms