Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nop56Q9D6Z1 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nop56Q9D6Z1 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nop56Q9D6Z1 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nop56Q9D6Z1 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Nop56Q9D6Z1 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Nop56Q9D6Z1 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Nop56Q9D6Z1 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Nop56Q9D6Z1 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Nop56Q9D6Z1 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Nop56Q9D6Z1 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nop56Q9D6Z1 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Nop56Q9D6Z1 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nop56Q9D6Z1 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nop56Q9D6Z1 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Nop56Q9D6Z1 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Nop56Q9D6Z1 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Nop56Q9D6Z1 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nop56Q9D6Z1 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nop56Q9D6Z1 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Nop56Q9D6Z1 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Nop56Q9D6Z1 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Nop56Q9D6Z1 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nop56Q9D6Z1 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Nop56Q9D6Z1 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nop56Q9D6Z1 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nop56Q9D6Z1 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Nop56Q9D6Z1 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Nop56Q9D6Z1 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nop56Q9D6Z1 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nop56Q9D6Z1 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nop56Q9D6Z1 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nop56Q9D6Z1 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nop56Q9D6Z1 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nop56Q9D6Z1 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nop56Q9D6Z1 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nop56Q9D6Z1 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nop56Q9D6Z1 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Nop56Q9D6Z1 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Nop56Q9D6Z1 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nop56Q9D6Z1 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nop56Q9D6Z1 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nop56Q9D6Z1 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nop56Q9D6Z1 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Nop56Q9D6Z1 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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