Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y7

Msra, Mitochondrial peptide methionine sulfoxide reductase, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsraQ9D6Y7 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MsraQ9D6Y7 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MsraQ9D6Y7 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MsraQ9D6Y7 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MsraQ9D6Y7 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MsraQ9D6Y7 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MsraQ9D6Y7 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MsraQ9D6Y7 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MsraQ9D6Y7 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MsraQ9D6Y7 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MsraQ9D6Y7 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MsraQ9D6Y7 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MsraQ9D6Y7 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MsraQ9D6Y7 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MsraQ9D6Y7 Gm15003-201ENSMUST00000118884 446 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
MsraQ9D6Y7 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
MsraQ9D6Y7 Gm14993-201ENSMUST00000121180 164 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
MsraQ9D6Y7 Gm12682-201ENSMUST00000144637 1081 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MsraQ9D6Y7 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MsraQ9D6Y7 Gm13572-201ENSMUST00000153675 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MsraQ9D6Y7 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MsraQ9D6Y7 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MsraQ9D6Y7 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MsraQ9D6Y7 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MsraQ9D6Y7 Gm6423-201ENSMUST00000204315 934 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
MsraQ9D6Y7 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
MsraQ9D6Y7 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MsraQ9D6Y7 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MsraQ9D6Y7 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MsraQ9D6Y7 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MsraQ9D6Y7 Prss55-201ENSMUST00000089338 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MsraQ9D6Y7 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MsraQ9D6Y7 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MsraQ9D6Y7 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MsraQ9D6Y7 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MsraQ9D6Y7 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
MsraQ9D6Y7 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MsraQ9D6Y7 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MsraQ9D6Y7 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MsraQ9D6Y7 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MsraQ9D6Y7 Ccdc90b-202ENSMUST00000085017 1494 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MsraQ9D6Y7 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MsraQ9D6Y7 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MsraQ9D6Y7 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
MsraQ9D6Y7 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MsraQ9D6Y7 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MsraQ9D6Y7 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MsraQ9D6Y7 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MsraQ9D6Y7 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
MsraQ9D6Y7 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MsraQ9D6Y7 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MsraQ9D6Y7 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MsraQ9D6Y7 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MsraQ9D6Y7 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MsraQ9D6Y7 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MsraQ9D6Y7 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MsraQ9D6Y7 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MsraQ9D6Y7 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MsraQ9D6Y7 Zfp1-202ENSMUST00000211926 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MsraQ9D6Y7 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MsraQ9D6Y7 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MsraQ9D6Y7 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MsraQ9D6Y7 Trav11-201ENSMUST00000103585 343 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MsraQ9D6Y7 Trav11d-201ENSMUST00000103648 342 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MsraQ9D6Y7 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
MsraQ9D6Y7 Snrnp25-202ENSMUST00000121182 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MsraQ9D6Y7 Gm13008-201ENSMUST00000142289 507 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MsraQ9D6Y7 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
MsraQ9D6Y7 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
MsraQ9D6Y7 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
MsraQ9D6Y7 Trav11n-201ENSMUST00000200113 343 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
MsraQ9D6Y7 Gm3433-201ENSMUST00000210149 1058 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
MsraQ9D6Y7 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MsraQ9D6Y7 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MsraQ9D6Y7 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MsraQ9D6Y7 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MsraQ9D6Y7 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MsraQ9D6Y7 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MsraQ9D6Y7 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MsraQ9D6Y7 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MsraQ9D6Y7 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MsraQ9D6Y7 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MsraQ9D6Y7 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MsraQ9D6Y7 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
MsraQ9D6Y7 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
MsraQ9D6Y7 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
MsraQ9D6Y7 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
MsraQ9D6Y7 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
MsraQ9D6Y7 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
MsraQ9D6Y7 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
MsraQ9D6Y7 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
MsraQ9D6Y7 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
MsraQ9D6Y7 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
MsraQ9D6Y7 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms