Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96 ms