Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Pramef12Q9D2F1 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pramef12Q9D2F1 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pramef12Q9D2F1 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pramef12Q9D2F1 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pramef12Q9D2F1 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pramef12Q9D2F1 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pramef12Q9D2F1 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pramef12Q9D2F1 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pramef12Q9D2F1 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pramef12Q9D2F1 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pramef12Q9D2F1 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pramef12Q9D2F1 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pramef12Q9D2F1 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pramef12Q9D2F1 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pramef12Q9D2F1 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pramef12Q9D2F1 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Pramef12Q9D2F1 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pramef12Q9D2F1 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pramef12Q9D2F1 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Pramef12Q9D2F1 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Pramef12Q9D2F1 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pramef12Q9D2F1 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pramef12Q9D2F1 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Pramef12Q9D2F1 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Pramef12Q9D2F1 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Pramef12Q9D2F1 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Pramef12Q9D2F1 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Pramef12Q9D2F1 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pramef12Q9D2F1 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Pramef12Q9D2F1 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pramef12Q9D2F1 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Pramef12Q9D2F1 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pramef12Q9D2F1 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pramef12Q9D2F1 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pramef12Q9D2F1 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pramef12Q9D2F1 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pramef12Q9D2F1 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Pramef12Q9D2F1 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pramef12Q9D2F1 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pramef12Q9D2F1 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pramef12Q9D2F1 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Pramef12Q9D2F1 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pramef12Q9D2F1 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pramef12Q9D2F1 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pramef12Q9D2F1 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pramef12Q9D2F1 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pramef12Q9D2F1 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pramef12Q9D2F1 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pramef12Q9D2F1 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pramef12Q9D2F1 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pramef12Q9D2F1 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pramef12Q9D2F1 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Pramef12Q9D2F1 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Pramef12Q9D2F1 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pramef12Q9D2F1 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pramef12Q9D2F1 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pramef12Q9D2F1 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pramef12Q9D2F1 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pramef12Q9D2F1 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pramef12Q9D2F1 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pramef12Q9D2F1 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Pramef12Q9D2F1 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pramef12Q9D2F1 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pramef12Q9D2F1 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pramef12Q9D2F1 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pramef12Q9D2F1 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Pramef12Q9D2F1 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pramef12Q9D2F1 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pramef12Q9D2F1 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pramef12Q9D2F1 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pramef12Q9D2F1 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pramef12Q9D2F1 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Pramef12Q9D2F1 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pramef12Q9D2F1 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pramef12Q9D2F1 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pramef12Q9D2F1 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pramef12Q9D2F1 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Pramef12Q9D2F1 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Pramef12Q9D2F1 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pramef12Q9D2F1 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Pramef12Q9D2F1 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pramef12Q9D2F1 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pramef12Q9D2F1 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pramef12Q9D2F1 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pramef12Q9D2F1 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pramef12Q9D2F1 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pramef12Q9D2F1 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pramef12Q9D2F1 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pramef12Q9D2F1 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pramef12Q9D2F1 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pramef12Q9D2F1 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pramef12Q9D2F1 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Pramef12Q9D2F1 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pramef12Q9D2F1 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pramef12Q9D2F1 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pramef12Q9D2F1 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Pramef12Q9D2F1 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pramef12Q9D2F1 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pramef12Q9D2F1 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms