Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.4 ms