Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Z3

Tmem53, Transmembrane protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem53Q9D0Z3 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem53Q9D0Z3 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem53Q9D0Z3 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem53Q9D0Z3 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem53Q9D0Z3 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem53Q9D0Z3 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem53Q9D0Z3 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem53Q9D0Z3 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem53Q9D0Z3 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem53Q9D0Z3 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem53Q9D0Z3 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem53Q9D0Z3 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem53Q9D0Z3 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem53Q9D0Z3 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem53Q9D0Z3 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem53Q9D0Z3 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem53Q9D0Z3 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem53Q9D0Z3 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem53Q9D0Z3 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem53Q9D0Z3 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem53Q9D0Z3 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem53Q9D0Z3 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem53Q9D0Z3 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem53Q9D0Z3 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem53Q9D0Z3 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem53Q9D0Z3 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem53Q9D0Z3 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem53Q9D0Z3 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem53Q9D0Z3 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem53Q9D0Z3 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem53Q9D0Z3 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem53Q9D0Z3 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem53Q9D0Z3 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem53Q9D0Z3 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem53Q9D0Z3 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem53Q9D0Z3 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem53Q9D0Z3 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem53Q9D0Z3 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem53Q9D0Z3 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem53Q9D0Z3 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem53Q9D0Z3 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem53Q9D0Z3 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem53Q9D0Z3 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem53Q9D0Z3 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem53Q9D0Z3 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem53Q9D0Z3 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem53Q9D0Z3 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem53Q9D0Z3 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem53Q9D0Z3 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem53Q9D0Z3 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem53Q9D0Z3 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem53Q9D0Z3 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem53Q9D0Z3 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem53Q9D0Z3 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem53Q9D0Z3 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem53Q9D0Z3 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem53Q9D0Z3 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem53Q9D0Z3 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem53Q9D0Z3 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem53Q9D0Z3 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem53Q9D0Z3 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem53Q9D0Z3 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem53Q9D0Z3 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem53Q9D0Z3 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem53Q9D0Z3 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem53Q9D0Z3 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem53Q9D0Z3 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem53Q9D0Z3 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem53Q9D0Z3 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem53Q9D0Z3 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem53Q9D0Z3 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem53Q9D0Z3 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem53Q9D0Z3 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem53Q9D0Z3 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem53Q9D0Z3 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem53Q9D0Z3 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem53Q9D0Z3 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem53Q9D0Z3 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem53Q9D0Z3 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem53Q9D0Z3 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem53Q9D0Z3 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem53Q9D0Z3 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem53Q9D0Z3 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem53Q9D0Z3 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem53Q9D0Z3 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem53Q9D0Z3 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem53Q9D0Z3 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem53Q9D0Z3 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem53Q9D0Z3 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem53Q9D0Z3 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem53Q9D0Z3 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem53Q9D0Z3 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem53Q9D0Z3 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem53Q9D0Z3 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem53Q9D0Z3 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem53Q9D0Z3 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem53Q9D0Z3 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem53Q9D0Z3 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem53Q9D0Z3 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem53Q9D0Z3 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms