Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0T1

Snu13, NHP2-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snu13Q9D0T1 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snu13Q9D0T1 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snu13Q9D0T1 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snu13Q9D0T1 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snu13Q9D0T1 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snu13Q9D0T1 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snu13Q9D0T1 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snu13Q9D0T1 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snu13Q9D0T1 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snu13Q9D0T1 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snu13Q9D0T1 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snu13Q9D0T1 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snu13Q9D0T1 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snu13Q9D0T1 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snu13Q9D0T1 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snu13Q9D0T1 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snu13Q9D0T1 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snu13Q9D0T1 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snu13Q9D0T1 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Snu13Q9D0T1 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snu13Q9D0T1 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snu13Q9D0T1 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snu13Q9D0T1 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snu13Q9D0T1 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snu13Q9D0T1 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snu13Q9D0T1 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snu13Q9D0T1 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snu13Q9D0T1 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snu13Q9D0T1 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snu13Q9D0T1 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Snu13Q9D0T1 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snu13Q9D0T1 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snu13Q9D0T1 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Snu13Q9D0T1 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snu13Q9D0T1 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Snu13Q9D0T1 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snu13Q9D0T1 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Snu13Q9D0T1 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Snu13Q9D0T1 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Snu13Q9D0T1 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snu13Q9D0T1 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snu13Q9D0T1 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snu13Q9D0T1 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snu13Q9D0T1 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Snu13Q9D0T1 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Snu13Q9D0T1 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snu13Q9D0T1 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snu13Q9D0T1 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snu13Q9D0T1 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snu13Q9D0T1 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snu13Q9D0T1 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snu13Q9D0T1 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snu13Q9D0T1 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snu13Q9D0T1 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snu13Q9D0T1 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snu13Q9D0T1 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snu13Q9D0T1 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snu13Q9D0T1 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snu13Q9D0T1 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snu13Q9D0T1 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snu13Q9D0T1 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snu13Q9D0T1 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snu13Q9D0T1 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Snu13Q9D0T1 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snu13Q9D0T1 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Snu13Q9D0T1 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snu13Q9D0T1 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snu13Q9D0T1 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Snu13Q9D0T1 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snu13Q9D0T1 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snu13Q9D0T1 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snu13Q9D0T1 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snu13Q9D0T1 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snu13Q9D0T1 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snu13Q9D0T1 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snu13Q9D0T1 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snu13Q9D0T1 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Snu13Q9D0T1 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snu13Q9D0T1 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snu13Q9D0T1 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snu13Q9D0T1 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Snu13Q9D0T1 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Snu13Q9D0T1 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snu13Q9D0T1 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Snu13Q9D0T1 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snu13Q9D0T1 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snu13Q9D0T1 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snu13Q9D0T1 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snu13Q9D0T1 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snu13Q9D0T1 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snu13Q9D0T1 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snu13Q9D0T1 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snu13Q9D0T1 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snu13Q9D0T1 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Snu13Q9D0T1 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snu13Q9D0T1 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snu13Q9D0T1 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snu13Q9D0T1 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snu13Q9D0T1 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snu13Q9D0T1 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms