Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms