Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN7

Shmt2, Serine hydroxymethyltransferase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shmt2Q9CZN7 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Shmt2Q9CZN7 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Shmt2Q9CZN7 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Shmt2Q9CZN7 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Shmt2Q9CZN7 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Shmt2Q9CZN7 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Shmt2Q9CZN7 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Shmt2Q9CZN7 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Shmt2Q9CZN7 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Shmt2Q9CZN7 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Shmt2Q9CZN7 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Shmt2Q9CZN7 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Shmt2Q9CZN7 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Shmt2Q9CZN7 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Shmt2Q9CZN7 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Shmt2Q9CZN7 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Shmt2Q9CZN7 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Shmt2Q9CZN7 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Shmt2Q9CZN7 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Shmt2Q9CZN7 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Shmt2Q9CZN7 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Shmt2Q9CZN7 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Shmt2Q9CZN7 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Shmt2Q9CZN7 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Shmt2Q9CZN7 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Shmt2Q9CZN7 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Shmt2Q9CZN7 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Shmt2Q9CZN7 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Shmt2Q9CZN7 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Shmt2Q9CZN7 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Shmt2Q9CZN7 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Shmt2Q9CZN7 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Shmt2Q9CZN7 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Shmt2Q9CZN7 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Shmt2Q9CZN7 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Shmt2Q9CZN7 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Shmt2Q9CZN7 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Shmt2Q9CZN7 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Shmt2Q9CZN7 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Shmt2Q9CZN7 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Shmt2Q9CZN7 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Shmt2Q9CZN7 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Shmt2Q9CZN7 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Shmt2Q9CZN7 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Shmt2Q9CZN7 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Shmt2Q9CZN7 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Shmt2Q9CZN7 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Shmt2Q9CZN7 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Shmt2Q9CZN7 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Shmt2Q9CZN7 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Shmt2Q9CZN7 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Shmt2Q9CZN7 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Shmt2Q9CZN7 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Shmt2Q9CZN7 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Shmt2Q9CZN7 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Shmt2Q9CZN7 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Shmt2Q9CZN7 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Shmt2Q9CZN7 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Shmt2Q9CZN7 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Shmt2Q9CZN7 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Shmt2Q9CZN7 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Shmt2Q9CZN7 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Shmt2Q9CZN7 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Shmt2Q9CZN7 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Shmt2Q9CZN7 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Shmt2Q9CZN7 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Shmt2Q9CZN7 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Shmt2Q9CZN7 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Shmt2Q9CZN7 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Shmt2Q9CZN7 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Shmt2Q9CZN7 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Shmt2Q9CZN7 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Shmt2Q9CZN7 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Shmt2Q9CZN7 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Shmt2Q9CZN7 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Shmt2Q9CZN7 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Shmt2Q9CZN7 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Shmt2Q9CZN7 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Shmt2Q9CZN7 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Shmt2Q9CZN7 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Shmt2Q9CZN7 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Shmt2Q9CZN7 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Shmt2Q9CZN7 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Shmt2Q9CZN7 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Shmt2Q9CZN7 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Shmt2Q9CZN7 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Shmt2Q9CZN7 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Shmt2Q9CZN7 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Shmt2Q9CZN7 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Shmt2Q9CZN7 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Shmt2Q9CZN7 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Shmt2Q9CZN7 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Shmt2Q9CZN7 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Shmt2Q9CZN7 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Shmt2Q9CZN7 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Shmt2Q9CZN7 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Shmt2Q9CZN7 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Shmt2Q9CZN7 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Shmt2Q9CZN7 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Shmt2Q9CZN7 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms