Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYW4

Hdhd3, Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdhd3Q9CYW4 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Hdhd3Q9CYW4 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Hdhd3Q9CYW4 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Hdhd3Q9CYW4 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Hdhd3Q9CYW4 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Hdhd3Q9CYW4 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Hdhd3Q9CYW4 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Hdhd3Q9CYW4 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Hdhd3Q9CYW4 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Hdhd3Q9CYW4 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Hdhd3Q9CYW4 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Hdhd3Q9CYW4 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Hdhd3Q9CYW4 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Hdhd3Q9CYW4 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Hdhd3Q9CYW4 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Hdhd3Q9CYW4 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Hdhd3Q9CYW4 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Hdhd3Q9CYW4 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Hdhd3Q9CYW4 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Hdhd3Q9CYW4 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Hdhd3Q9CYW4 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Hdhd3Q9CYW4 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Hdhd3Q9CYW4 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Hdhd3Q9CYW4 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Hdhd3Q9CYW4 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Hdhd3Q9CYW4 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Hdhd3Q9CYW4 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Hdhd3Q9CYW4 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Hdhd3Q9CYW4 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Hdhd3Q9CYW4 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Hdhd3Q9CYW4 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Hdhd3Q9CYW4 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Hdhd3Q9CYW4 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Hdhd3Q9CYW4 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Hdhd3Q9CYW4 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Hdhd3Q9CYW4 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Hdhd3Q9CYW4 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Hdhd3Q9CYW4 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Hdhd3Q9CYW4 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Hdhd3Q9CYW4 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Hdhd3Q9CYW4 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Hdhd3Q9CYW4 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Hdhd3Q9CYW4 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Hdhd3Q9CYW4 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Hdhd3Q9CYW4 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hdhd3Q9CYW4 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hdhd3Q9CYW4 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Hdhd3Q9CYW4 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Hdhd3Q9CYW4 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Hdhd3Q9CYW4 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hdhd3Q9CYW4 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Hdhd3Q9CYW4 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Hdhd3Q9CYW4 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Hdhd3Q9CYW4 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Hdhd3Q9CYW4 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hdhd3Q9CYW4 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hdhd3Q9CYW4 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Hdhd3Q9CYW4 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hdhd3Q9CYW4 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hdhd3Q9CYW4 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Hdhd3Q9CYW4 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hdhd3Q9CYW4 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hdhd3Q9CYW4 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hdhd3Q9CYW4 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hdhd3Q9CYW4 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hdhd3Q9CYW4 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hdhd3Q9CYW4 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hdhd3Q9CYW4 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hdhd3Q9CYW4 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hdhd3Q9CYW4 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hdhd3Q9CYW4 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hdhd3Q9CYW4 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hdhd3Q9CYW4 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hdhd3Q9CYW4 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hdhd3Q9CYW4 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hdhd3Q9CYW4 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hdhd3Q9CYW4 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Hdhd3Q9CYW4 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Hdhd3Q9CYW4 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hdhd3Q9CYW4 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Hdhd3Q9CYW4 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hdhd3Q9CYW4 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hdhd3Q9CYW4 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hdhd3Q9CYW4 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hdhd3Q9CYW4 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Hdhd3Q9CYW4 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Hdhd3Q9CYW4 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Hdhd3Q9CYW4 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Hdhd3Q9CYW4 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Hdhd3Q9CYW4 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Hdhd3Q9CYW4 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Hdhd3Q9CYW4 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Hdhd3Q9CYW4 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Hdhd3Q9CYW4 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Hdhd3Q9CYW4 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Hdhd3Q9CYW4 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Hdhd3Q9CYW4 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Hdhd3Q9CYW4 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Hdhd3Q9CYW4 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Hdhd3Q9CYW4 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.1 ms