Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY25

Mis12, Protein MIS12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis12Q9CY25 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75 ms