Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Gm10652-201ENSMUST00000199790 2622 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 293.1 ms