Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Tram2-201ENSMUST00000037998 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Celsr2-201ENSMUST00000090558 10598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Nrp2-202ENSMUST00000063594 6342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Peg10-201ENSMUST00000166678 6662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Gnas-223ENSMUST00000185956 3729 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Gnas-224ENSMUST00000186907 3729 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Pak7-201ENSMUST00000035264 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Usp45-201ENSMUST00000040429 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Rrm2b-201ENSMUST00000022901 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 8030423F21Rik-201ENSMUST00000064097 2851 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Celsr3-201ENSMUST00000024238 11547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Vwa7-202ENSMUST00000172499 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Mrgpre-201ENSMUST00000054048 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Fmod-201ENSMUST00000048183 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Sorbs3-203ENSMUST00000227653 3061 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Rhobtb1-201ENSMUST00000020101 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 C330027C09Rik-202ENSMUST00000117994 3977 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
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