Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWH6

Psma8, Proteasome subunit alpha type-7-like, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma8Q9CWH6 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Psma8Q9CWH6 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Psma8Q9CWH6 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Psma8Q9CWH6 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Psma8Q9CWH6 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Psma8Q9CWH6 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Psma8Q9CWH6 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Psma8Q9CWH6 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Psma8Q9CWH6 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Psma8Q9CWH6 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Psma8Q9CWH6 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Psma8Q9CWH6 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Psma8Q9CWH6 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Psma8Q9CWH6 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Psma8Q9CWH6 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Psma8Q9CWH6 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Psma8Q9CWH6 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Psma8Q9CWH6 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Psma8Q9CWH6 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Psma8Q9CWH6 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Psma8Q9CWH6 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Psma8Q9CWH6 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Psma8Q9CWH6 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Psma8Q9CWH6 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Psma8Q9CWH6 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Psma8Q9CWH6 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Psma8Q9CWH6 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Psma8Q9CWH6 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Psma8Q9CWH6 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Psma8Q9CWH6 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Psma8Q9CWH6 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Psma8Q9CWH6 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Psma8Q9CWH6 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Psma8Q9CWH6 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Psma8Q9CWH6 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Psma8Q9CWH6 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Psma8Q9CWH6 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Psma8Q9CWH6 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Psma8Q9CWH6 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Psma8Q9CWH6 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Psma8Q9CWH6 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Psma8Q9CWH6 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Psma8Q9CWH6 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Psma8Q9CWH6 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Psma8Q9CWH6 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Psma8Q9CWH6 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Psma8Q9CWH6 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Psma8Q9CWH6 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Psma8Q9CWH6 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Psma8Q9CWH6 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Psma8Q9CWH6 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Psma8Q9CWH6 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Psma8Q9CWH6 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Psma8Q9CWH6 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Psma8Q9CWH6 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Psma8Q9CWH6 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Psma8Q9CWH6 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Psma8Q9CWH6 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Psma8Q9CWH6 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Psma8Q9CWH6 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Psma8Q9CWH6 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Psma8Q9CWH6 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Psma8Q9CWH6 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Psma8Q9CWH6 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Psma8Q9CWH6 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Psma8Q9CWH6 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Psma8Q9CWH6 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Psma8Q9CWH6 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Psma8Q9CWH6 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Psma8Q9CWH6 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Psma8Q9CWH6 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Psma8Q9CWH6 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Psma8Q9CWH6 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Psma8Q9CWH6 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Psma8Q9CWH6 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Psma8Q9CWH6 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Psma8Q9CWH6 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Psma8Q9CWH6 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Psma8Q9CWH6 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Psma8Q9CWH6 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Psma8Q9CWH6 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Psma8Q9CWH6 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Psma8Q9CWH6 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Psma8Q9CWH6 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Psma8Q9CWH6 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Psma8Q9CWH6 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Psma8Q9CWH6 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Psma8Q9CWH6 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Psma8Q9CWH6 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Psma8Q9CWH6 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Psma8Q9CWH6 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Psma8Q9CWH6 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Psma8Q9CWH6 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Psma8Q9CWH6 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Psma8Q9CWH6 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Psma8Q9CWH6 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Psma8Q9CWH6 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Psma8Q9CWH6 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Psma8Q9CWH6 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Psma8Q9CWH6 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms