Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Snw1Q9CSN1 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Snw1Q9CSN1 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Snw1Q9CSN1 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Snw1Q9CSN1 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Snw1Q9CSN1 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Snw1Q9CSN1 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Snw1Q9CSN1 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Snw1Q9CSN1 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Snw1Q9CSN1 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Snw1Q9CSN1 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Snw1Q9CSN1 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Snw1Q9CSN1 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Snw1Q9CSN1 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Snw1Q9CSN1 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Snw1Q9CSN1 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Snw1Q9CSN1 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Snw1Q9CSN1 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Snw1Q9CSN1 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Snw1Q9CSN1 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Snw1Q9CSN1 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Snw1Q9CSN1 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snw1Q9CSN1 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snw1Q9CSN1 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snw1Q9CSN1 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snw1Q9CSN1 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snw1Q9CSN1 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snw1Q9CSN1 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snw1Q9CSN1 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snw1Q9CSN1 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snw1Q9CSN1 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snw1Q9CSN1 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snw1Q9CSN1 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snw1Q9CSN1 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snw1Q9CSN1 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snw1Q9CSN1 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snw1Q9CSN1 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snw1Q9CSN1 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snw1Q9CSN1 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snw1Q9CSN1 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Snw1Q9CSN1 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snw1Q9CSN1 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snw1Q9CSN1 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snw1Q9CSN1 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snw1Q9CSN1 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snw1Q9CSN1 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snw1Q9CSN1 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Snw1Q9CSN1 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snw1Q9CSN1 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snw1Q9CSN1 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snw1Q9CSN1 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Snw1Q9CSN1 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snw1Q9CSN1 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snw1Q9CSN1 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snw1Q9CSN1 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snw1Q9CSN1 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snw1Q9CSN1 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snw1Q9CSN1 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snw1Q9CSN1 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snw1Q9CSN1 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snw1Q9CSN1 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Snw1Q9CSN1 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snw1Q9CSN1 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snw1Q9CSN1 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snw1Q9CSN1 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snw1Q9CSN1 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snw1Q9CSN1 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snw1Q9CSN1 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snw1Q9CSN1 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snw1Q9CSN1 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snw1Q9CSN1 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snw1Q9CSN1 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snw1Q9CSN1 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snw1Q9CSN1 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snw1Q9CSN1 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snw1Q9CSN1 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snw1Q9CSN1 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snw1Q9CSN1 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snw1Q9CSN1 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snw1Q9CSN1 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snw1Q9CSN1 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snw1Q9CSN1 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snw1Q9CSN1 Gm19087-201ENSMUST00000191430 946 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Snw1Q9CSN1 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snw1Q9CSN1 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Snw1Q9CSN1 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Snw1Q9CSN1 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snw1Q9CSN1 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snw1Q9CSN1 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snw1Q9CSN1 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snw1Q9CSN1 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snw1Q9CSN1 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snw1Q9CSN1 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snw1Q9CSN1 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snw1Q9CSN1 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snw1Q9CSN1 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snw1Q9CSN1 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snw1Q9CSN1 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Snw1Q9CSN1 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Snw1Q9CSN1 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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