Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW9

Ifitm3, Interferon-induced transmembrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifitm3Q9CQW9 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ifitm3Q9CQW9 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ifitm3Q9CQW9 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ifitm3Q9CQW9 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ifitm3Q9CQW9 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ifitm3Q9CQW9 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ifitm3Q9CQW9 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ifitm3Q9CQW9 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ifitm3Q9CQW9 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ifitm3Q9CQW9 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ifitm3Q9CQW9 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ifitm3Q9CQW9 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ifitm3Q9CQW9 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ifitm3Q9CQW9 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ifitm3Q9CQW9 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ifitm3Q9CQW9 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ifitm3Q9CQW9 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ifitm3Q9CQW9 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ifitm3Q9CQW9 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ifitm3Q9CQW9 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ifitm3Q9CQW9 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ifitm3Q9CQW9 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ifitm3Q9CQW9 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ifitm3Q9CQW9 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ifitm3Q9CQW9 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ifitm3Q9CQW9 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ifitm3Q9CQW9 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ifitm3Q9CQW9 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ifitm3Q9CQW9 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ifitm3Q9CQW9 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ifitm3Q9CQW9 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ifitm3Q9CQW9 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ifitm3Q9CQW9 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ifitm3Q9CQW9 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ifitm3Q9CQW9 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ifitm3Q9CQW9 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ifitm3Q9CQW9 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ifitm3Q9CQW9 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ifitm3Q9CQW9 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ifitm3Q9CQW9 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ifitm3Q9CQW9 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ifitm3Q9CQW9 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ifitm3Q9CQW9 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ifitm3Q9CQW9 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ifitm3Q9CQW9 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ifitm3Q9CQW9 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Ifitm3Q9CQW9 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ifitm3Q9CQW9 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ifitm3Q9CQW9 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Ifitm3Q9CQW9 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Ifitm3Q9CQW9 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ifitm3Q9CQW9 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Ifitm3Q9CQW9 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Ifitm3Q9CQW9 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ifitm3Q9CQW9 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ifitm3Q9CQW9 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ifitm3Q9CQW9 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ifitm3Q9CQW9 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ifitm3Q9CQW9 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ifitm3Q9CQW9 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ifitm3Q9CQW9 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ifitm3Q9CQW9 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Ifitm3Q9CQW9 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ifitm3Q9CQW9 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ifitm3Q9CQW9 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ifitm3Q9CQW9 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ifitm3Q9CQW9 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ifitm3Q9CQW9 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ifitm3Q9CQW9 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ifitm3Q9CQW9 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ifitm3Q9CQW9 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ifitm3Q9CQW9 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ifitm3Q9CQW9 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ifitm3Q9CQW9 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ifitm3Q9CQW9 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ifitm3Q9CQW9 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ifitm3Q9CQW9 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ifitm3Q9CQW9 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ifitm3Q9CQW9 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ifitm3Q9CQW9 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Ifitm3Q9CQW9 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ifitm3Q9CQW9 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ifitm3Q9CQW9 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ifitm3Q9CQW9 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ifitm3Q9CQW9 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ifitm3Q9CQW9 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ifitm3Q9CQW9 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ifitm3Q9CQW9 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ifitm3Q9CQW9 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ifitm3Q9CQW9 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ifitm3Q9CQW9 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ifitm3Q9CQW9 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ifitm3Q9CQW9 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ifitm3Q9CQW9 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ifitm3Q9CQW9 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ifitm3Q9CQW9 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ifitm3Q9CQW9 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ifitm3Q9CQW9 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ifitm3Q9CQW9 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ifitm3Q9CQW9 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms