Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
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Ykt6Q9CQW1 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Ykt6Q9CQW1 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Ykt6Q9CQW1 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Ykt6Q9CQW1 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Ykt6Q9CQW1 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Ykt6Q9CQW1 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Ykt6Q9CQW1 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Ykt6Q9CQW1 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Ykt6Q9CQW1 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Ykt6Q9CQW1 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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