Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms