Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ90

Uncharacterized protein C9orf85 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQ90 AC125487.2-201ENSMUST00000219810 1300 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9CQ90 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9CQ90 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9CQ90 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9CQ90 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9CQ90 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9CQ90 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9CQ90 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9CQ90 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9CQ90 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9CQ90 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9CQ90 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9CQ90 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9CQ90 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9CQ90 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9CQ90 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9CQ90 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9CQ90 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9CQ90 Mup17-201ENSMUST00000107484 927 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9CQ90 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9CQ90 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9CQ90 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9CQ90 Gm14358-201ENSMUST00000118458 403 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9CQ90 Gm13676-201ENSMUST00000122185 591 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9CQ90 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9CQ90 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9CQ90 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9CQ90 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9CQ90 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9CQ90 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9CQ90 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9CQ90 Gm21489-201ENSMUST00000189668 818 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9CQ90 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9CQ90 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9CQ90 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9CQ90 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9CQ90 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9CQ90 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9CQ90 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9CQ90 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9CQ90 mt-Co2-201ENSMUST00000082405 684 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9CQ90 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9CQ90 Mir350-201ENSMUST00000083639 99 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9CQ90 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9CQ90 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9CQ90 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9CQ90 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9CQ90 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9CQ90 Araf-202ENSMUST00000120356 1520 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9CQ90 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9CQ90 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9CQ90 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9CQ90 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9CQ90 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9CQ90 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9CQ90 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9CQ90 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9CQ90 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9CQ90 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9CQ90 Gm42905-201ENSMUST00000196237 1611 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9CQ90 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9CQ90 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9CQ90 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9CQ90 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9CQ90 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9CQ90 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9CQ90 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9CQ90 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9CQ90 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9CQ90 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9CQ90 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9CQ90 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9CQ90 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9CQ90 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9CQ90 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9CQ90 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9CQ90 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9CQ90 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9CQ90 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9CQ90 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9CQ90 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9CQ90 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9CQ90 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9CQ90 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9CQ90 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9CQ90 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9CQ90 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9CQ90 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9CQ90 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9CQ90 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9CQ90 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9CQ90 Kat6b-203ENSMUST00000112458 997 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9CQ90 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9CQ90 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9CQ90 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9CQ90 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9CQ90 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9CQ90 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9CQ90 Gm11871-201ENSMUST00000122429 1061 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9CQ90 A230083N12Rik-201ENSMUST00000126646 572 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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