Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV0

Prpf8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf8Q99PV0 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Il17rd-201ENSMUST00000035336 8280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Prpf8Q99PV0 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Prpf8Q99PV0 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Prpf8Q99PV0 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Prpf8Q99PV0 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Prpf8Q99PV0 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Prpf8Q99PV0 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Prpf8Q99PV0 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Prpf8Q99PV0 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Prpf8Q99PV0 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Prpf8Q99PV0 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Prpf8Q99PV0 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Prpf8Q99PV0 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Prpf8Q99PV0 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Prpf8Q99PV0 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Prpf8Q99PV0 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Prpf8Q99PV0 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Prpf8Q99PV0 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Prpf8Q99PV0 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Prpf8Q99PV0 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Prpf8Q99PV0 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Prpf8Q99PV0 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Prpf8Q99PV0 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Prpf8Q99PV0 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Prpf8Q99PV0 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Prpf8Q99PV0 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Prpf8Q99PV0 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Prpf8Q99PV0 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Prpf8Q99PV0 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Prpf8Q99PV0 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Prpf8Q99PV0 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Prpf8Q99PV0 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Prpf8Q99PV0 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Prpf8Q99PV0 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Prpf8Q99PV0 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Prpf8Q99PV0 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Prpf8Q99PV0 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Prpf8Q99PV0 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Prpf8Q99PV0 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Prpf8Q99PV0 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Prpf8Q99PV0 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Prpf8Q99PV0 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Prpf8Q99PV0 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Prpf8Q99PV0 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Prpf8Q99PV0 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Prpf8Q99PV0 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Prpf8Q99PV0 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Prpf8Q99PV0 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Prpf8Q99PV0 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Prpf8Q99PV0 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Prpf8Q99PV0 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Prpf8Q99PV0 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Prpf8Q99PV0 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Prpf8Q99PV0 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Prpf8Q99PV0 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Prpf8Q99PV0 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Prpf8Q99PV0 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Prpf8Q99PV0 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Prpf8Q99PV0 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Prpf8Q99PV0 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Prpf8Q99PV0 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Prpf8Q99PV0 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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