Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms